События развиваются в альтернативной вселенной, напоминающей мир начала XX века. Наряду с технологическими достижениями учёные смогли разработать сложную магию. При сочетании этой магии и науки были созданы схемы, способные даровать жизнь и личность неживым объектам. Таких существ стали называть «механическими куклами», или «автоматами». История вращается вокруг мальчика-кукольника по имени Райшин Акабанэ. Он — японский школьник, который перешёл в Королевскую Вальпургиеву Академию Машинных
Мирная жизнь Дайсукэ Хигасиды, студента первого курса престижной школы, подготавливающей учеников к поступлению в университет, дает трещину, когда в один прекрасный день фирма его отца разоряется. Работать юноша не хочет, но и ежедневно проезжать 15 километров до школы на велосипеде, впрочем, тоже, а потому все же решает устроиться в семейный кафе-ресторан «Вагнария» на неполный рабочий день. И влиться серьезному Дайсукэ в трудовой коллектив, состоящий из чудаковатых сотрудников заведения,
Старшеклассник Рё Сакагути — яойщик, обожающий читать истории о любви между парнями. Казалось бы, ему прямая дорога в школу для мальчиков — ан-нет. Рё рассудил по-другому. Он учится в смешанной школе, где проводит время с другими экстравагантными личностями: яойщицей Руми, президентом кулинарного клуба Юдзиро, собратом-яойщиком Дайго, а также своим «нормальным» другом Тосиаки.