Главную героиню аниме зовут Рюко Матой. Однажды девочка отправилась навестить отца и стала свидетельницей его убийства: в тело была воткнута половина огромных красных ножниц, а вдалеке виднелся силуэт человека, который убегал со второй половиной. Рюко решает отыскать убийцу и отомстить за отца, но единственной уликой были те самые ножницы. Девушка путешествует по стране, пытаясь выяснить происхождение этих ножниц, попутно тоже используя их как оружие. Очередным пунктом в её путешествии оказался остров Хонно, на котором находился город и элитная школа "Академия Хоннодзи". Здесь Рюко встречает девушку по имени Мако, которая становится ей подругой и рассказывает о местных порядках.

Особенностью школы является её особая униформа, сотканная из "нитей жизни" - таким образом, форма определённого ранга (есть как обычные ученики, так и главы клубов, члены студсовета и так далее) может наделять носителя сверхъестественными способностями. Ученикам приходится участвовать в выполнении нечеловеческих заданий и боях не на жизнь, а на смерть, чтобы побороться за право носить чудесную одежду. А во главе ученического совета стоит старшеклассница Сацуки Кирюин, которая отличается суровым нравом и является сильнейшим учеником академии. Именно Сацуки Кирюин, увидев половинку ножниц в руках Матой, отреагировала так, будто ей что-то о них известно. Но делиться информацией явно не желала, поэтому Рюко придётся выбивать её силой. Однако девушка проиграла уже в самом первом бою - с одним из слабейших учеников академии, ведь у неё-то не было волшебной униформы. Раненая, она возвращается в дом отца и вдруг проваливается в руины под зданием, где внезапно обнаруживается похожая школьная форма - да ещё обладающая сознанием. Теперь Рюко и её новым друзьям предстоит борьба со всей школой - пока им не удастся добраться до вершины и Сацуки Кирюин.