Люди Икс — команда наделённых суперсилой мутантов, которые были собраны профессором Чарльзом Ксавьером для защиты простых смертных. Однако общество не признаёт «выродков», и ученики профессора вынуждены спасать тех, кто готов перегрызть им глотку.

После гибели одного из своих членов команда прекращает свою деятельность. Спустя год профессор получает известие о таинственном исчезновении в Японии девочки-мутанта. Подозревая, что за этим стоит нечто большее, Ксавьер вновь собирает команду и поручает ей расследование.

Опасения профессора подтвердились: герои очень скоро обнаруживают связь между исчезновением девочки и группой людей, называющих себя Люди Ю.